MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI05

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009959	C	7	7	1	7	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_009959	TCC	2	6	1766	1771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009959	GTCGT	2	10	1775	1784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009959	GGGC	2	8	1789	1796	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009959	CCG	2	6	1861	1866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009959	GGA	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009959	GC	4	8	3713	3720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009959	CGT	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009959	GGA	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009959	GGC	2	6	5642	5647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009959	GCC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009959	GACC	2	8	7665	7672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009959	CCCG	2	8	7681	7688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_009959	C	6	6	8730	8735	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_009959	GAGG	2	8	8754	8761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009959	CAA	2	6	8795	8800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009959	CGG	2	6	8830	8835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009959	GGC	2	6	9715	9720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009959	GTCT	2	8	14147	14154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009959	G	6	6	14164	14169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009959	TGGG	2	8	14212	14219	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009959	GC	3	6	18224	18229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009959	GCT	2	6	18234	18239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009959	GC	3	6	21360	21365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009959	TGTC	2	8	21378	21385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009959	AGG	2	6	21392	21397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009959	CG	3	6	22302	22307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009959	AGC	2	6	22319	22324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009959	TC	3	6	22378	22383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009959	CA	3	6	22411	22416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009959	GA	3	6	22418	22423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009959	GC	3	6	23400	23405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009959	GC	5	10	24031	24040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009959	TCC	2	6	25106	25111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009959	GC	3	6	25122	25127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009959	CG	3	6	25163	25168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009959	GGC	2	6	25173	25178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009959	CG	3	6	25186	25191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009959	CGG	2	6	25220	25225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009959	GCC	2	6	25956	25961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009959	GC	3	6	25983	25988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009959	TC	3	6	27339	27344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009959	CTGGT	2	10	27346	27355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009959	G	6	6	27387	27392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009959	GC	4	8	27400	27407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009959	CG	3	6	27416	27421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009959	CCGC	2	8	27431	27438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_009959	G	6	6	27442	27447	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009959	TC	3	6	29139	29144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009959	GGCAA	2	10	29159	29168	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009959	CGC	2	6	29169	29174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009959	C	7	7	29190	29196	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_009959	GC	3	6	29214	29219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009959	CGC	3	9	29222	29230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009959	A	6	6	29237	29242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009959	CG	3	6	29263	29268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009959	CGC	2	6	30562	30567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009959	GCG	2	6	30577	30582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009959	CCTT	2	8	30943	30950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009959	CG	3	6	30973	30978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009959	GC	3	6	31013	31018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009959	CG	4	8	31028	31035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009959	CGG	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009959	GCG	2	6	31061	31066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009959	CCCGG	2	10	31358	31367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_009959	GGGCA	2	10	31421	31430	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009959	A	6	6	31465	31470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009959	ATTG	2	8	31497	31504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009959	AAG	2	6	31509	31514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009959	G	6	6	31521	31526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009959	CA	3	6	32297	32302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009959	CAGC	2	8	34696	34703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009959	GGA	2	6	34748	34753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009959	GC	3	6	35808	35813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009959	GCC	2	6	35817	35822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009959	GCC	2	6	35824	35829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009959	CGCCC	2	10	35897	35906	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
78	NC_009959	C	6	6	35904	35909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_009959	GCC	2	6	35913	35918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009959	CCG	2	6	35919	35924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009959	CAC	3	9	37221	37229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009959	CA	3	6	37268	37273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009959	GAC	2	6	37289	37294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009959	G	6	6	38303	38308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009959	C	6	6	38325	38330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_009959	TC	3	6	44850	44855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009959	TGA	2	6	44949	44954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009959	CCCCGC	2	12	45936	45947	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_009959	CCG	2	6	46612	46617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009959	GCG	2	6	46701	46706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009959	GAGG	2	8	46730	46737	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009959	CCCG	2	8	50464	50471	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_009959	GGA	2	6	50488	50493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009959	CGGG	2	8	51581	51588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009959	G	7	7	54537	54543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009959	CCG	2	6	57965	57970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009959	GC	3	6	57993	57998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009959	GGCG	2	8	57999	58006	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009959	CTGCC	2	10	58027	58036	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_009959	TAA	2	6	58828	58833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009959	CG	4	8	58848	58855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009959	CCG	2	6	58865	58870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009959	CGT	2	6	61515	61520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009959	GTT	2	6	61583	61588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009959	G	7	7	61686	61692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009959	AAG	2	6	61788	61793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009959	GCAG	2	8	61885	61892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009959	GCGG	2	8	63105	63112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009959	GGCAG	2	10	63778	63787	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009959	GGCG	2	8	63788	63795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009959	GGA	2	6	66262	66267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009959	GCG	2	6	67263	67268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009959	GC	3	6	70128	70133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009959	GAA	2	6	70186	70191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009959	AGCC	2	8	70638	70645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009959	A	8	8	71615	71622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009959	CTGA	2	8	71623	71630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009959	CGGGCG	2	12	71691	71702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.